阿尔茨海默氏病（AD）正日益成为全球关注的重要公共卫生问题，目前尚缺乏有效的针对性治疗手段。对AD患者脑部的多组学分析已揭示出β-淀粉样蛋白斑块和神经元tau蛋白缠结之外的多种复杂病理生理过程，但这些病理过程随时间演变的机制仍然不明确。因此，有必要探索多种生物标志物，以促进对AD潜在复杂疾病过程的理解。

最近，美国埃默里大学医学院的AD研究中心团队在Alzheimer’s Research & Therapy杂志上发表了一篇题为《Multi-platform proteomic analysis of Alzheimer’s disease cerebrospinal fluid and plasma reveals network biomarkers associated with proteostasis and the matrisome》的文章。通过采用三种不同的蛋白质组学平台（包括SomaLogic的SomaScan、Olink及TMT质谱法），该研究对来自相同受试者（n=18对照，n=18 AD）的阿尔茨海默病脑脊液（CSF）和血浆样本进行了深入分析。

研究结果显示，脑模块枢纽蛋白（如SMOC1）有望成为有价值的AD生物标志物。具体的研究步骤包括：步骤一，进行血浆和脑脊液中的蛋白技术检测；步骤二，进行跨平台蛋白对比；步骤三，比较血浆与脑脊液中蛋白含量；步骤四，分析脑蛋白模块在两种体液中的对比；步骤五，描述共表达网络及相关通路。

在本研究中，作者使用了来自埃默里大学Goizueta阿尔茨海默病研究中心的对照组（n=18）与AD患者（n=18）的脑脊液样本和血浆样本，进行了TMT蛋白质谱分析、Olink检测（1196种目标蛋白）、SomaScan（v41，针对6596个特征蛋白）。结果表明，相比于血浆样本，CSF的信噪比较低，缺失值较大。通过去除质谱数据中的14种高丰度蛋白，结合75%缺失值标准，筛选出适用于后续分析的数据。

在跨平台比较中，共检测到CSF中4655种独特蛋白质，而血浆中则有6794种独特蛋白质。SomaScan平台在血浆中提供了最全面的蛋白质组学覆盖，测量到4662种Olink和质谱未检测的独特蛋白。通过对数据进行相关性分析，与香港Jiang队列的血浆Olink数据以及BioFinder和AddNeuroMed队列中的数据进行了良好的相关性验证，相关性均在0.6至0.8之间。

分析结果显示，AD患者的CSF中蛋白质数量减少，而血浆中蛋白质减少程度更为明显。尽管队列规模有限，不同平台的分子重叠较少，但在校准数据后发现，相较于对照组，AD组中CSF和血浆蛋白均减少，且低丰度蛋白在血浆中的显著偏倚进一步证明了这一点。

作者构建的AD脑蛋白共表达网络揭示了与AD相关的多个模块，这些模块同样在CSF和血浆中表现出覆盖率的差异。该网络中，与AD认知功能密切相关的模块包括M15突触后膜模块和M8自噬模块。值得注意的是，AD组中SMOC1水平在CSF和血浆中均有所升高，且与Aβ/Tau水平呈相关性。

此外，血浆共表达网络显示出内吞作用和基质体病理生理学的强疾病相关模块，验证了CSF和血浆之间单一AD相关蛋白水平的差异。针对此研究，XPJ公司提供了针对AD小队列的高通量蛋白组检测服务，使研究者能在大规模的蛋白质组分析中获得深度、稳健与准确的数据，尤其是在血液蛋白质组的研究中。

总结而言，本研究利用质谱法、Olink靶向蛋白组和SomaScan高通量靶向蛋白组分别对AD的脑脊液和血浆样本进行了深入分析，展现了不同蛋白模块在两种样本中的表达关系。这为AD的患者分层、诊断、疾病监测及治疗开发提供了潜在的生物标志物基础。强烈推荐使用XPJ的超高深度靶向蛋白组检测服务，助力于推动阿尔茨海默氏病的研究进展。